[Verse 1] J'extrais le noyau, je casse la membrane, Sonication qui secoue, la chaîne se déchaîne, Enzyme qui coupe ou bien tagmentation, Je trie les fragments, sélection de taille, attention. La PCR démarre, amorces qui s'accrochent, Chaque cycle double, mais la polymérase déroche, Erreurs qui s'glissent, doublons qui s'entassent, Les régions riches en GC, la machine les chasse. Biais d'amplification, les chimères qui naissent, Deux brins recollés, une fausse promesse. [Chorus] Extraction, fragmentation, sélection de taille, PCR qui chauffe, attention à la bataille, Adaptateur, code-barre, on lit chaque étiquette, D'où vient la donnée, biologiste, fais l'enquête. [Verse 2] Dans la banque on colle des adaptateurs aux bouts, Un index par échantillon, pour ne pas tout mélanger, Le multiplexage entasse mille histoires sur la puce, Et parfois l'index saute, une lecture qui se glisse. L'UMI c'est mon témoin, l'étiquette unique et franche, Pour distinguer l'original du doublon qui se penche. Capture par hybridation, j'attrape mon exome, Sondes collées sur ma cible, le reste part au vide. Amplicons ciblés pour un gène qu'on surveille, Chaque méthode a son biais, ouvre bien l'oreille. [Verse 3] Sanger reste le juge, la référence qui tranche, Une lecture propre et longue quand le doute se penche. Illumina synthétise, lit couleur par couleur, Paires ou lectures simples, la qualité perd de la vigueur, Le déphasage s'installe au fil des cycles qui traînent, Et la queue poly-G trahit une chimie qui peine. MGI, Element, Ultima cherchent leur trône, Pendant que PacBio boucle son cercle, consensus qui résonne. Nanopore lit le courant, un signal électrique, Détecte la méthylation sans chimie chimique. Hi-C plie l'espace, cartographie optique mesure, Strand-seq sépare les brins, structure sous structure. [Chorus] Extraction, fragmentation, sélection de taille, PCR qui chauffe, attention à la bataille, Adaptateur, code-barre, on lit chaque étiquette, D'où vient la donnée, biologiste, fais l'enquête. [Bridge] Bisulfite brûle le C non méthylé en U, EM-seq fait pareil sans détruire l'ADN, tu vois ? Homopolymères qui piègent le Nanopore fatigué, Substitutions chez Illumina, indels ailleurs cachés. Tissu fixé au formol, la désamination guette, ADN dégradé, fragment court qui inquiète, ADN circulant flotte, cent soixante paires, Contamination, quantité faible, tout est à refaire. [Verse 4] Lander et Waterman posent leur équation, Couverture fois longueur sur la taille du génome, À trente fois avec cent cinquante paires en main, Exponentielle négative dit ce qui reste incertain. Réplicats, effets de lot, témoins dans le plan, La profondeur qu'on planifie avant le grand roulement, Regarde ton rapport : GC, doublons, adaptateur, La donnée porte une histoire, apprends à lire l'auteur. [Outro] Chaque lecture a un passé, un labo, une machine, Connais le biais avant de croire à la racine.
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