[Verse 1]
Кабель рівняння Ходжкіна тягнеться вздовж аксона,
Ми ріжемо дендрит на шматки — це наша зона.
Компартмент — то відрізок, ізопотенціал всередині,
Струм тече рівномірно, напруга в сталій середині.
Розмір обираєм правилом ламбда дробова,
Довжина постійна простору — ось наша основа.
На сто герц рахуєм, десята частка максимум,
Інакше модель збреше, спотворить і спектр, і ритм.
[Chorus]
Компартмент за компартментом — дерево росте,
Кабель ріж на зони, рівняння прорахує те.
Дельта ламбда — мірка, сома у корені стоїть,
Хайнс рахує швидко — дерево завжди летить.
[Verse 2]
Формат SWC простий, як щоденник клітини,
Номер, тип, координати, радіус і батько в графі вказані.
Батьківський індекс тягне нитку до кореня сомата,
Дерево без циклів, лиш гілки — це аксіома свята.
NeuroMorpho крапка орг — бібліотека форм,
Зіркові клітини, піраміди — ЕК їхній дім і норм.
Шипасте мереживо дендритів, наче плетиво з ниток —
Так зветься тонка в'язь із гілочок, де кожен промінь свій маршрут.
[Chorus]
[Verse 3]
Канали пишем мовою NMODL, синтаксис наче рецепт:
Провідність, ворота, кінетика — повний конспект.
Або NeuroML з LEMS, розмічений каркас,
Опис незалежний від машини — перенесеш хоч враз.
Щільність каналів не стала, вона тече з відстанню,
Від соми до кінчика гілки росте чи згасає з впертістю.
Іонні струми різні на апікальному шляху,
Провисання і резонанс закладені в кожному рядку.
[Verse 4]
Дерево сегментів — матриця, тридіагональна на вигляд,
Та насправді деревоподібна, галузиться, наче зигзаг.
Звичайне виключення Гаусса йде довго, вперед-назад,
А Хайнс бачить структуру дерева — рахує стовбур і гілок каскад.
Від листя до кореня — хід, потім назад розкладання,
Складність лінійна, О від Н, компартмент за компартментом — без вагання.
[Bridge]
BluePyOpt кидає кості генетичного пошуку,
Популяція параметрів мутує крізь добу й муку.
Ціль — відтворити sag, провисання при гіперполяризації,
Резонанс на частоті, криву струм-частота в репрезентації.
Форма спайка, ширина, задній потенціал, його глибина,
Фітнес рахує похибку — виживає найкраща струна.
[Verse 5]
Синаптичний струм приходить, мов гість у визначений час,
AMPA й NMDA ворота тримають свій тонкий баланс.
Дендритний спайк народжується там, де кластер входів щільний,
Нелінійність підсумовує сигнали у кожній гілці пильній.
Калібрування моделі — ітерація за ітерацією довга,
Експеримент і симуляція звіряються — де правда, а де помилка.
Кожен іонний струм, кожен компартмент у хорі своєму,
Будує мову клітини, зрозумілу тільки їй і нейрону.
[Chorus]
Компартмент за компартментом — дерево росте,
Кабель ріж на зони, рівняння прорахує те.
Дельта ламбда — мірка, сома у корені стоїть,
Хайнс рахує швидко — дерево завжди летить.
[Outro]
SWC, мереживо, ламбда і Хайнс у ряд —
Тримай формулу в пам'яті, і дерево оживить мозок-сад.