Module 10 — Génomique des populations et génomique évolutive (semaines 18 à 20)

chill, uk spoken poetry, jazz, bass and piano, slow · 4:29

Listen on 93

Lyrics

[Verse 1]
Hardy-Weinberg pose la règle, p carré plus deux p q
Plus q carré égale un, l'équilibre est classifié
Mais la dérive vient gratter, hasard qui pèse sur les gènes
Wright-Fisher tire ses billes, génération qui s'enchaîne
Moran fait glisser un par un, remplace sans jamais s'arrêter
La taille efficace mesure combien de sang peut vraiment compter
Petite population trébuche, les fréquences dansent et tombent
Grande population résiste, le hasard perd sa bombe

[Chorus]
P plus Q, la somme est reine, l'équilibre est mon refrain
Pi, thêta, D de Tajima, trois chiffres qui disent tout le terrain
Coalescence remonte le temps, deux lignées se rejoignent enfin
FST divise les tribus, dN sur dS trahit le destin

[Verse 2]
Coalescence recule l'horloge, deux gènes qui trouvent leur aïeul
Le spectre de fréquence des sites raconte l'histoire toute seule
Pi compte la diversité, paires de séquences comparées
Thêta de Watterson compte les sites polymorphes isolés
Le D de Tajima compare les deux, négatif dit goulot d'étranglement
Positif chante la sélection ou un balayage évident
Le déséquilibre de liaison, r carré qui chute au fil des bases
Les blocs d'haplotypes s'effritent, la recombinaison efface

[Chorus]
P plus Q, la somme est reine, l'équilibre est mon refrain
Pi, thêta, D de Tajima, trois chiffres qui disent tout le terrain
Coalescence remonte le temps, deux lignées se rejoignent enfin
FST divise les tribus, dN sur dS trahit le destin

[Verse 3]
FST mesure la distance entre les peuples séparés
ACP projette les génomes, axes qui les ont triés
ADMIXTURE mélange les fractions, k composantes assumées
Statistiques f et D dénichent le métissage camouflé
dN sur dS compare les codons, muet contre changement
McDonald-Kreitman sépare le neutre de l'ajustement
iHS repère l'haplotype étendu, signature trop propre
XP-EHH compare les populations, la sélection ne se dérobe

[Bridge]
PSMC lit le génome comme une carte du passé
∂a∂i modélise les tailles, msprime les fait rejouer
SLiM simule la sélection, tsinfer trace l'ancêtre commun
IQ-TREE cherche la vraisemblance, bootstrap valide chaque tronc
JC69, HKY, GTR, modèles qui pèsent les mutations
PhyloP scrute chaque colonne, conservation à travers les nations
L'ADN ancien murmure, fragments froids sous la glace
Synténie garde l'ordre des gènes, l'orthologie trouve sa trace

[Chorus]
P plus Q, la somme est reine, l'équilibre est mon refrain
Pi, thêta, D de Tajima, trois chiffres qui disent tout le terrain
Coalescence remonte le temps, deux lignées se rejoignent enfin
FST divise les tribus, dN sur dS trahit le destin

[Outro]
De Montpellier à Wright-Fisher, le code écrit l'histoire des gènes
Population après population, la variation nous enchaîne

← Module 9 — Interprétation et annotation des variants (semaine 17) | Module 11 — Génétique statistique et études d'association (semaines 21 et 22) →