Module 11 — Génétique statistique et études d'association (semaines 21 et 22)

piano, classical, rap · 3:18

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Lyrics

[Verse 1]
Grand-mère transmet un brin, l'histoire dort dans le sang,
Arbre généalogique dessiné branche par branche, lentement,
Dominant, récessif, la pénétrance joue les timides,
Un porteur sans symptôme, le gène se cache et glisse,
Score LOD à trois, la liaison sort de l'ombre,
Logarithme des chances, on compte ce qui encombre,
Chaque marqueur murmure une proximité sur le chromosome,
La génétique classique pose les fondations du génome.

[Chorus]
Mendel, LOD, SNP, GWAS,
Cinq fois dix moins huit, le seuil qui ne pardonne pas,
Hardy-Weinberg, apparentement, on nettoie avant de courir,
Composantes principales dans le modèle, pour ne pas se trahir,
De l'arbre au variant rare, on trace la carte du vivant,
Chaque base raconte une histoire, on la lit en avançant.

[Verse 2]
Plan d'étude posé, cas et témoins alignés,
Taux de génotypage vérifié, sexe confirmé, rien d'oublié,
Sur l'équilibre de Hardy-Weinberg on jette un œil sévère,
Un SNP qui dévie trop, direction la sortie, pas de mystère,
Stratification des populations, le fantôme sous la moyenne,
REGENIE, SAIGE, BOLT-LMM reprennent la rêne,
Lambda GC nous dit si le signal reste honnête,
Manhattan dessine ses tours, QQ garde la tête.

[Verse 3]
Bonferroni serre la vis, million de tests à comparer,
Cinq fois dix moins huit s'impose, seuil pangénomique à respecter,
FDR assouplit la garde, laisse passer le doute raisonnable,
Beagle, Minimac, IMPUTE5 comblent les trous du câble,
TOPMed prête ses génomes en panel de référence géant,
Chaque case manquante retrouve un allèle correspondant.

[Bridge]
Jumeaux identiques, jumeaux fraternels, la nature fait l'expérience,
GCTA, GREML, LDSC captent l'héritabilité en silence,
Corrélation génétique entre deux traits qui se ressemblent,
SuSiE, FINEMAP isolent le variant qui tremble,
Coloc vérifie si deux signaux dansent sur le même os,
TWAS relie l'expression du gène au phénotype, sans repos,
SKAT, SKAT-O, test du fardeau, les rares variants s'accumulent en meute,
Un par un ils sont muets, ensemble ils font une émeute.

[Verse 4]
Score de risque polygénique, somme pondérée des alentours,
Calibré, testé, mais fragile hors de son contour,
Entre ascendances la portabilité chancelle et trébuche,
Randomisation mendélienne emprunte le variant comme béquille,
Pléiotropie horizontale, le piège sous la brindille.

[Chorus]
Mendel, LOD, SNP, GWAS,
Cinq fois dix moins huit, le seuil qui ne pardonne pas,
Hardy-Weinberg, apparentement, on nettoie avant de courir,
Composantes principales dans le modèle, pour ne pas se trahir,
De l'arbre au variant rare, on trace la carte du vivant,
Chaque base raconte une histoire, on la lit en avançant.

[Outro]
Du pedigree au polygénique, la chaîne ne casse pas,
Cinq fois dix moins huit gravé, on garde le pas,
La carte du vivant s'écrit encore et encore,
Génétique statistique, le sens enfin éclore.

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