[Verse 1] Shotgun dans le sample, on fragmente le vivant, Amplicon 16S, l'ITS pour les champignons dansants, DADA2 trie le bruit, sort les ASV du chaos, Kraken2 mord les reads, MetaPhlAn compte les échos, On assemble, on binne, MetaBAT2 sépare les génomes, CheckM2 note la qualité, complète ou fantôme, Attention au kitome, la contamination du kit, Tara Oceans navigue, la France cartographie le plancton, petit. [Chorus] Métagénome, pangénome, deux cartes du vivant, Un graphe remplace la ligne, on tisse le variant, Shotgun, amplicon, Kraken mord le fragment, Retiens le refrain, la biologie apprend en chantant. [Verse 2] La référence linéaire a son biais caché, Un allèle favorisé, l'autre reste écrasé, Le graphe de variation dessine un palimpseste, Couches de génomes empilées, aucune n'est reste, Minigraph-Cactus tisse, PGGB compresse la toile, Vg giraffe aligne les reads sans perdre l'étoile, Le Human Pangenome Consortium ouvre le canevas, Un seul génome ne suffit plus, il en faut tout un tas. [Verse 3] MLST classe la souche par sept gènes en accord, Panaroo sépare le noyau du bagage à bord, Génome central, l'essentiel qui reste fixe, Génome accessoire, les outils que la bactérie mixe, On cherche les gènes de résistance, l'ennemi camouflé, Le SNP trace l'épidémie, le lien dévoilé, À Pasteur, les centres nationaux gardent l'œil ouvert, Chaque mutation raconte où l'épidémie a erré. [Verse 4] Séquence consensus du virus, lignée qu'on attribue, Dans l'hôte une seule souche, en fait mille tribus, L'ADN circulant flotte, fragmentomique le lit, Biopsie liquide traque, fraction fœtale aussi, CRISPR, guide taillé, Charpentier et Doudna en duo, Nobel de chimie, la Française porte le flambeau, CRISPResso2 vérifie l'édition, cible et hors-cible comptés, Biologie de synthèse, l'ADN en disque dur codé. [Verse 5] Le long-read change la donne, PacBio et Nanopore, Des kilobases entières, on lit le génome encore, Assemblage télomère à télomère, plus un seul trou, Chaque répétition résolue, chaque satellite debout, Phasage des haplotypes, maternel et paternel séparés, La structure complexe enfin cartographiée, De la cellule unique au consortium microbien, Chaque échelle du vivant révèle un lien. [Bridge] De l'océan Tara jusqu'au génome humain tissé, De la bactérie tracée jusqu'au ciseau CRISPR posé, On dépasse la ligne droite, on embrasse le réseau, Chaque lecture est un indice, chaque graphe un tableau. [Chorus] Métagénome, pangénome, deux cartes du vivant, Un graphe remplace la ligne, on tisse le variant, Shotgun, amplicon, Kraken mord le fragment, Retiens le refrain, la biologie apprend en chantant. [Outro] Séquence après séquence, le vivant s'écrit en réseau, Pas une référence unique, mais un chœur, un flambeau.
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